Родился 16 августа 1911 г.
1929–1933 гг. – студент Казанского государственного университета и с 1930 г. – начальник научно-исследовательской партии (изучение железных руд и бокситов Урала). С 1933 г. – аспирант-заочник университета, технорук, старший геолог, научный руководитель Центральной научно-исследовательской лаборатории треста «Востокнефть» (г. Уфа). В 1938 г. защитил кандидатскую диссертацию. 1940–1942 гг. – главный геолог треста «Ишимбайнефть».
С началом войны потребность в нефти резко возросла, а вывоз ее из Азербайджана был затруднен, так как немецкая армия дошла до Волги и Северного Кавказа. По твердому настоянию А.А.Трофимука в Карлинско-Кинзебулатовской зоне брахиантиклинальных складок начато бурение скважин. Первые скважины показали отсутствие пород-коллекторов и многие видные геологи настаивали на прекращении бурения. Однако А.А. обосновал наличие коллекторов трещинного типа в пермских отложениях, проявил настойчивость и мужество. В 1943 г. забил мощный фонтан нефти. Затем в Приуралье, в Ишимбаевском районе было открыто еще несколько нефтяных месторождений. В январе 1944 г. А.А.Трофимук получил звание Героя Социалистического труда.
А.А.Трофимук обосновал поисковое бурение на девонскую нефть и в 1944 г. на Туймазинской площади было открыто большое месторождение нефти, в 1946 г. – Бавлинское и другие месторождения. Так что наша военная техника на заключительном этапе Отечественной войны питалась девонской нефтью Башкирии!
В 1946 г. присуждена Сталинская премия 1 степени за открытие месторождений девонской нефти; в 1949 г. защитил докторскую диссертацию; в 1950 г. вторично присуждена Сталинская премия 1 степени за разработку и осуществление законтурного заводнения Туймазинского месторождения.
1950–1953 гг. – главный геолог Главнефтеразведки Миннефтепрома СССР; 1953 г. – член-корреспондент АН СССР; 1955–1957 гг. – директор Всесоюзного нефтегазового НИИ (Москва).
1957–1988 гг. – директор ИГГ СО АН СССР; 1958 г. – избран действительным членом АН СССР; 1958–1988 гг. – зам. председателя СО АН СССР; 1960 г. – профессор НГУ; 1983 г. – Почетный гражданин г. Новосибирска; 1988–1999 гг. – советник Президиума АН СССР; с 1988 г. – Почетный директор ИГГ СО АН СССР (с 1990 г. – ОИГГМ СО РАН).
Награды: ордена Ленина (шесть), Октябрьской революции, Трудового Красного Знамени (два). Орден «За заслуги перед Отечеством» IV степени отказался получать от Президента РФ Б.Н.Ельцина. Медали: «За трудовую доблесть», «За доблестный труд в Великой Отечественной войне 1941–1945 гг.», «За доблестный труд в ознаменование 100-летия со дня рождения В.И.Ленина», «За освоение недр и развитие нефтегазового комплекса Западной Сибири», «Ветеран труда», юбилейные (20, 30, 40, 50 лет Победы); звания – Герой Социалистического труда, Лауреат Сталинской премии (1946, 1950), Лауреат премии АН СССР им. А.П.Карпинского, Заслуженный деятель науки и техники РСФСР, Почетный нефтяник Миннефтепрома СССР, Заслуженный деятель науки Якутской АССР, Башкирской АССР, Бурятской АССР, Почетный разведчик недр, Почетный академик РАЕН, Почетный член Российской экологической академии.
Умер 24 марта 1999 г.
В 2000 г. Объединенному институту геологии, геофизики и минералогии СО РАН присвоено имя академика А.А.Трофимука.
Сведения в основном взяты из кн.: Андрей Алексеевич Трофимук. Изд. второе, дополненное. Составители: Д.Х.Гик, Р.И.Кузьменко, Г.С.Фрадкин. М., «Наука», 1991. – 176 с.